تدار مؤسسة وكالة إنعاش وتنمية أقاليم الشمال من خلال مجلس إداري برئاسة السيد رئيس الحكومة، ويتركب من عضوية ممثلي الدولة المعين عددهم بمقتضى القانون ( أنظر المرسوم / نافذة القوانين ). وتوجه الدعوة إلى رؤساء المجلسين الجهويين ( جهة طنجة – تطوان / وجهة تازة-الحسيمة-تاونات )، ورؤساء المجالس الإقليمية لعمالات وأقاليم الشمال بالمملكة لحضور أشغال المجلس بصفة استشارية. كما يمكن للمجلس أن يوجه الدعوة إلى كل شخص سواء أفرادا أو هيآت بالقطاع العام أو الخاص يرى فائدة في حضوره اجتماعاته.
تحدد سلطات ومهام المجلس في ما يلي:
- اقتراح بشكل دوري على السلطات المعنية بناء على إستراتيجية شاملة ودراسات أنجزتها الوكالة أو أبلغت لها، برامج الأنشطة المساعدة على تنمية القطاعات الاقتصادية والاجتماعية لمدار الوكالة،
- حصر ميزانية الوكالة والبث في مخصصاتها،
- وضع برنامج سنوي للمشاريع التي سيتم إنجازها سواء تلك التي تقدمت بها الدولة للوكالة أو الأشخاص المعنوية العامة المجالية المعنية،
- إحداث عند الاقتضاء لجن تحدد تركيبتها ومهامها،
- البث في النظام الأساسي للأطر العاملة بالوكالة،
- تحديد شروط وكيفيات تفويت الصفقات العمومية،
- مناقشة التقارير المنجزة من طرف لجنة المراقبة المالية للدولة،
- نشر التقرير السنوي للوكالة في إطار المهام المخولة لها بمقتضى قانون إحداثها ( المادة 5 من قانون 95-06 )،
برنامج اجتماع المجلس الإداري يتمحور حول النقط التالية:
1- أنشطة الوكالة برسم السنة المنصرمة لكل اجتماع،
2- البرنامج الاقتصادي والاجتماعي للوكالة،
3- التقرير المالي والمحاسبي،
4- مشروع الميزانية للسنة المالية المرتقبة،
5- مختلفات.
ولقد عقدت الوكالة آخر اجتماع لها بتاريخ 6 أبريل 2011 بالرباط، وقد كانت الاجتماعات السابقة تنعقد بشكل دوري بالعملات والأقاليم مدار تدخل الوكالة، ويشكل المجلس فرصة مواتية للمنتخبين لإغناء النقاش، وإبداء الآراء واقتراح مشاريع جديدة يمكن إضافتها إلى البرنامج العام للوكالة.